まずどこのイベントに参加するのか書いてください。そしてその質問はイベント主催者に聞くのが1番です(よくある質問に回答が既にある場合もありますよ)。
個人的には列ができるようなサークルでもなければなんで2スペも取ってるの？サーチケ目当て？って思ってしまいます。最近満了どこも早いし。そもそもそれぞれ別ジャンルなんですよね？合体でスペースとるんですよね？片方のスペースは訳わかんない配置になりますけどいいんですか？買う側からしたら全然違うジャンルの島の中にあったらよっぽど好きなサークル以外買い物に行きません。2つスペース取って合同にしないでそれぞれのジャンルで配置してもらって片方は友達に売り子任せるのがベターだと思います。

即売会などのイベントで２スペースが与えられる基本は
・名義が違う（合体など）
・頒布物がとても多い、購入列の混雑が予想される
といったところでしょうか。

コミケなどの場合、同じ人物が２スペース分申し込むとどちらも落選対象となります。
サークル名だけでなく、名義も別（別人物）が申し込んでの合体ならば問題なさそうです。

他のオールジャンル系イベントでも、合体申し込みなどはありますから、
同様のスタイルでの申込みは可能だと思います。

ただ、同一人物、要はトピ主様お一人での申込みだと
２スペース分を管理しなければなりません。
同時にスペースに買い物に来た一般参加者の対応や、
置き引き対策・不審物の対応もお一人でされるとなると、
運営からストップがかかることも考えられます。

また、頒布物の量が多いなどの理由で２スペース取られるのであれば通りやすいですが、
Aジャンル新刊50冊、Bスペース新刊50冊などだと２スペース分を確保させて貰えないかも知れません。

ジャンルで分けたい気持ちは分かりますが、
トピ主さんのサークル規模・参加イベントなどが不明なため、
場合によっては自スペを簡単な仕切りで半々に分け、
ジャンルを分けて本を置くなどを考えるのも良いかも知れません。

回答ありがとうございます。
すみません、紛らわしい書き方をしてしまったのですが1スペース内で2サークルの参加が可能かという文面のつもりでした。わかりづらく申し訳ございません。

回答いただいた中だと、片方は委託扱いで参加というのが告知の面も含め個人的にやりやすいかなと思いました。
またイベントによってルールが異なるようなので、参加前にサイトの確認や問い合わせなどをしっかりしようと思いました。
サークル規模は今まで混雑したことない島中サークルなので大丈夫だろうと思っています。

また今回は一人1スペースでの参加を考えていますが、
もし今後2スペース（あるいはそれ以上）での参加を検討した時は、売り子を頼んだりすることも考えようと思いました。
回答していただき、ありがとうございました。