自分も男性向け女性向けを問わず食べるショタメインの人間ですが、そう言われるとあまり気にしたことがありませんね…。
性器の描写が多いのが男性向け、性器より表情に重きを置いてるのが女性向けってイメージは若干あります。
ストーリーが商業BLっぽかったら自分は女性向けに設定しますね。

男性向けイベント出れるなら男性向け
出れないなと思うなら女性向け
作者がどちらに馴染めるかって感じだと思う
女性向けメンタル(？)なのに男性向け名乗るのは男性向けの人は嫌うから

女性向けも男性向けも両方読むけど、商業BLぽいストーリーなら女性向けにするかな
トピ主さんの絵柄やショタのタイプによるかもしれませんが…

私は男性向けしか見ないなわりとBLっぽい雰囲気の多いと思うけどな

ちやほやされたいなら男性向け、面倒に巻き込まれたくないなら女性向けかな。
以前、たまたま前の前の前辺りのジャンルの推しカプの受け側がショタキャラかつ、そのキャラが男性にもかなりウケるタイプのショタだったので、カプ者の大半がショタコンの男性だったんだけど、ショタコンの男の大半は必ずどこかがやべえ奴らの集まりだから、そういった意味でも面倒ごとに巻き込まれたくなければ女性向け一択だよ。

以前たまたま好きになったカプの受けが幼い見た目で、イベントは女性向けに出たんですが購入者の半分が男性だったことがありました。
全年齢本だったので、成人向けならまた話は別かと思うんですが、それ以降もしかしてあんまりショタは男性向け女性向けの概念ないのかな？と自分もどこが境界線なのか気になってます。
個人的には男性向けは攻めがモブっぽかったり顔映らなかったりのイメージなんですが、自分が描いてたのは攻めの顔もがっつりだったので…(偏見もありそうですが)

受けメインで攻めはただの棒なら男性向け
そうじゃないなら女性向けかな
男性向けって夢っぽい考え方が強い

数年前、自分もどっちがいいのか似たような事で悩んでて、コミケの申込書を買いに直接店舗へ行ってスタッフさんに聞いてみたら「自分の作品がどの層に見てもらいたいかで決めていいと思います」ってひとつお答えいただいたんです。なるほどなぁと思いました。
よければ参考までに。