前の方とは違う考え方になっちゃいますが、自分はちょっと危ういかなーと思います。

商業作品のタイトルやロゴは商標登録されていることが多いと思いますが、商標の侵害は著作権のように親告罪ではないです。版元の黙認範囲を超えてしまいます。

また、別ジャンルとはいえ、そのタイトルロゴを見た人が公式との関連を誤解してしまうこともあるかもしれません。

なので、上の方のおっしゃるように、(似て見えるかもしれないけど)全然違うものだよ！と言えるくらいには手を加えたほうが良いのではないかなと思います。

あとは、程度問題になると思います。
表紙に大きく目立つように描くのと、本文中の1コマに映り込みとして小さく描くのとでは全然違いますし…
その別ジャンルが同人活動を歓迎してるかどうかも関係すると思います。

基本的には自己責任になるとは思いますが、聞かれたらそう答えるしかないでしょうか…